четверг, 28 февраля 2013 г.

Второе заседание кружка эпидмоделирования в ЦНИИОИЗ

Форма для регистрации на кружок

На прошедшем 28 февраля 2013 заседании кружка С.С. Сошников сделал доклад о методах добычи данных (Data Mining), включающих логистическую регрессию, деревья принятия решений, нейронные сети и метод частичных наименьших квадратов и другие. Данный подход математического моделирования был использован автором для изучения факторов, которые оказывают существенное влияние на ряд изучаемых социально-значимых показателей здоровья общества. Представлены модели показателей трех болезней, в том числе заболеваемости (а по сути - выявляемости) алкоголизма на 1000 населения, числа абортов на 1000 женщин в возрасте 15-49 лет и смертности детей в возрасте до 1 года, в качестве зависимых переменных. 
Материалами исследования явились  данные Федеральной службы государственной статистики России. В общей сложности собрано 130 переменных из разных опубликованных сборников Росстата за десять лет с 2000 по 2009 год. Для сбора данных разработана исследовательская база данных SEIPH (Social-Economics Interference & Public Health), которая содержит более 100 000 наблюдений на уровне региона России. Стандартизированные переменные базы данных SEIPH охватывают широкий спектр социально-экономических характеристик субъектов России и могут быть разделены на пять групп: 
1 – Заболеваемость, распространенность болезней и причины смертности населения; 2 - Социальная инфраструктура и служба здравоохранения; 3 – Экономика, деньги, доходы; 4 – Демографические показатели; 5 – Внешние и связанные с алкоголем факторы.

Мощный инструмент Enterprise Miner для интеллектуального анализа данных компании SAS позволил построить многофакторные модели на больших данных официальной статистики России.  На основании критерия среднеквадратической ошибки, выбраны лучшие из построенных прогностические модели. Например распространенность легальных абортов лучше всего отразила логистическая регрессия, где окончательная модель состоит из 14 значимых признаков со скорректированным R² 80,85%. Коэфициент, который свидетельствует о сильнейшей связи показателя частоты абортов  с экономическим кластером, внешними факторами и алкоголем. Среди факторов, которые имеют значимое влияние на зависимую переменную - географические факторы, осложнения беременности, число врачей и больничных коек, демографические факторы, уровень продаж водки и потребления чистого алкоголя, валовой региональный продукт и доходы населения,  уровень развития образовательной инфраструктуры.
В представленном исследовании проведена попытка измерить влияние внешних ассоциированных факторов на несколько болезней, с помощью интеллектуального метода моделирования, применительно к данным официальной статистики, на уровне регионов России.

На практическом занятии по SAS мы разобрали раздел
"ВВОД ДАННЫХ И МАНИПУЛЯЦИЯ С НИМИ".
 Домашнее задание на 14 марта:
Прочитать и попробовать самостоятельно в SAS пройденный урок:
- Выполнить домашнее задание:
На следующем практическом занятии будем разбирать Графику в SAS.
- Ссылка на учебник: http://pubhealth.spb.ru/SASDIST/GraphCon.htm

- Напоминаем о возможности изучения программы SAS по видео-роликам в Youtube.
Ссылка на 14 обучающих модулей: http://www.youtube.com/playlist?list=PL7CB9B66A2F4FB9B3
- Пожалуйста зарегистрируйтесь в этой форме для Кружка: https://docs.google.com/forms/d/1nC60I_eL6bQh7-dcYaHrDG0xI1KOuJY-pfWOfaoM7Xg/viewform

У кружка есть новостной Твиттер: @EpidModel

воскресенье, 24 февраля 2013 г.

Конференция "20 лет модернизации российской статистики: опыт и перспективы"


Информация по международной научно-практической конференции«20 лет модернизации российской статистики: опыт и перспективы»
23-24 мая 2013 г. Федеральная служба государственной статистки (Росстат) проводит международную научно-практическую конференцию «20 лет модернизации российской статистики: опыт и перспективы».
Место проведения конференции: г. Москва, ул. Мясницкая, 39, строение 1, конференц-зал Росстата.
В 2013 г. международное статистическое сообщество отмечает Всемирный год статистики. Предстоящая конференция приурочена к этому событию, а также к 150-летию образования в России Центрального статистического комитета.
Росстат приглашает к участию в конференции производителей и пользователей статистической информации: представителей федеральных органов исполнительной власти, научной общественности и бизнес сообщества, коллег из международных организаций и национальных статистических служб.
На конференции будут рассмотрены:
- итоги модернизации российской статистической системы в 1992-2012 гг.;
- результаты выполнения долгосрочных программ развития российской статистики;
- соответствие российской статистики стандартам международных организаций;
- развитие информационных и коммуникационных технологий в официальной статистике;
-повышение статистической грамотности российского общества;
- проблемы и успехи реформирования статистических систем в странах с переходной экономикой;
- новые актуальные вопросы развития статистической науки и практики (интегрированная экономическая статистика, статистика глобализации, статистика устойчивого развития, большие данные).
Контактная информация:
107450, Россия, город Москва, улица Мясницкая, дом 39, строение 1.
E-mail: stat@gks.ru
Мамлеева Н.Н. тел.: (495) 607-46-37 ,
Сычев В.Е. тел: (495) 607-41- 95.  

вторник, 19 февраля 2013 г.

Конфликт интересов в тестировании подростков на наркотики

    Главному наркологу Минздрава удалось лоббировать принятие закона о поголовном тестировании всей молодежи на некоторые виды наркотиков. После прошлой неудачной наркополитики кривая инциденса (заболеваемости) наркомании должна пойти вниз. В качестве обоснования необходимости Е. Брюн приводит результаты своих исследований в интерьвью: "В одном из элитных ВУЗов умер студент от передозировки наркотиков. Нас пригласил ректор, мы всех обследовали, протестировали на наличие наркотиков, алкогольных проблем и обнаружили примерно 15% потребителей наркотиков. С каждым из них мы встретились, обсудили вопрос, зачем они это делают. 15-30 минут беседы с каждым из студентов позволяет в течение года снизить количество потребителей до 2%" [1].
Исследователи пришли в ВУЗ с набором тест-систем, методологией и протоколом исследования, видимо получив на это разрешение этических комитетов и разрешение Минздрава. На вопрос о  полученных данных Евегений Брюн отвечает:
"...если у школьника установлен опыт употребления наркотиков, то от этого его социальный статус не пострадает. «Никого не будут ставить ни на какой учет, не последуют санкции в отношении них, не будет никаких правовых последствий, не будет создаваться никакая база данных. Информация никуда уходить не будет - об этом будут знать только родители и сам школьник», - подчеркнул Брюн." [2].
Значит он хранит методологию исследования и базы данных по уже проведенным скринингам у себя в сейфе. Должно быть заключение этических комитетов и разрешение Минздрава, выданные до начала исследования. Результаты должны быть опубликованы в научных журналах с анонсированием в СМИ. 
   Распоряжение "Проработать вопрос об обязательном информировании медицинскими учреждениями города органов внутренних дел о выявлении при прохождении ежегодных медицинских диспансерных осмотров фактов употребления наркотиков учащимися общеобразовательных учебных заведений..." [3]. Предписывает врачам сдавать, выявленных тестированием потребителей наркотиков, детей в органы. 
    Главный нарколог проводил совместные исследования и публиковал научные статьи с владельцами патентов на тест-системы фирмы Общества с ограниченной ответственностью "ДИАНАРК" (ООО "ДИАНАРК")[5]. 


Продвигая именно эти тесты (Патент № 2442988) Е. Брюн издал письмо для региональных главных наркологов [6], в котором призывает всех обучаться “...новым методам диагностики раннего выявления потребления наркотических веществ... курс теоретического и практического обучения (72 академических часа) и овладение методами иммуноферментной диагностики ДИАНАРК® для раннего выявления потребителей наркотических средств и АДИМУСТАТ® для оценки иммунного статуса человека и установления факторов риска развития болезней зависимости.”

Учитывая, что по правилам Госзакупок предпочтение должно отдаваться Российским производителям России "спущено" обучение именно на этих тестах, ДИАНАРК будет очень доволен.

Ссылки:
3. Документ в PDF http://sch799.ru/parent/nark.pdf
5. Научные публикации фирмы Дианарк http://www.dianark.ru/info/publications/
6. Информационное письмо Е.Брюна главным наркологам регионов России http://nark-center.ru/upload/File/222.doc   

воскресенье, 10 февраля 2013 г.

Систематические обзоры РКИ по воздействию молитвы на течение болезни


Главные вывод из множества исследований и метаанализов - молитвы не снижают частоту негативных исходов и не помогают больным. Сравнение групп больных за которых молились с теми за кого не молились показывают, что молитва не помогает, а иногда даже вредит больным. На бога надеются, поэтому небрежно относятся к назначениям врача.

 Систематические обзоры клинических исследований по воздействию молитвы на течение болезни:

1. Intercessory prayer for the alleviation of ill health. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19370557

2. Prayer and healing: A medical and scientific perspective on randomized controlled trials http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2802370/

    Кокрановский обзор: "Заступническая молитва об облегчении состояния больного"
[Roberts L., Ahmed I., Hall S. Intercessory prayer for the alleviation of ill health (Cochrane Review). In: The Cochrane Library, Issue 2, 2003. Oxford: Update Software].
    Этот обзор сосредоточен только на заступнической молитве. Те, кто прибегает к ней, почти всегда убеждены, что обращаются к богу. Пока результаты суждений об эффективности молитвы не могут быть интерпретированы в терминах доказательств или опровержений ответа бога молящимся, ибо, можно допустить такую возможность, что действие молитвы может происходить и независимо от вмешательства божественной воли.

    Молитвы не влияют на число умерших от лейкемии или заболевании сердца (ОШ 1,11; ДИ 0,79-1,56; n = 1424). У страдающих заболеваниями сердечно-сосудистой системы заступническая молитва отчетливо не снижала шансы на плохой или промежуточный исход (ОШ 0,8; ДИ 0,64-1,00; n = 1444), но эти данные сместились к нулю после того, как в анализ были включены те, кто выбыл в процессе одного из исследований (см. выше - предположение негативного исхода). Молитва увеличивала шансы на повторное поступление в отделение сердечно-сосудистой патологии (ОШ 1,54 ДИ 1,02-2,33; n = 1406), однако после включения в окончательный анализ тех, кто выбыл в процессе исследования (предположение о плохом исходе), эти результаты стали статистически значимо отрицательными.
    Молитвы не православные, протестантские, раз речь о США и Европе. Однако "В группе тех, о ком молились, отмечалась более высокая частота беременностей, чем у тех, о ком не молились (50% vs. 26%, Р = 0,0013).". Молитва была как дополнение к основному лечению у исследуемой группы больных. качество молитвы не оценивалось, зато указано, что не подтверждена обратная связь от "бога".
    У далось найти авторов, которые, предлагают ввести заступническую молитву в клиническую практику. В работе [Leibovici L.: Effects of remote, retroactive intercessory prayer on outcomes in patients with bloodstream infection: randomised controlled trial. BMJ 2001 Dec. 22-29; 323:7327 p. 1450-1]

четверг, 7 февраля 2013 г.

Кружок по биостатистике и эпидмоделированию

Кружок эпидемиологии и математического моделирования
Кружок ориентирован на научное общество, специалистов фармакологических компаний, медицинских и других учреждений.
Цель: обмен опытом и повышение уровня знаний в области эпидемиологии и биостатистики, совместное изучение прикладных статистических программ.
Заседания проводятся раз в две недели на бесплатной основе по адресу: Москва, ул. Добролюбова 11, конференц-зал на 3 этаже.

Расписание:

14 Февраля 2013
ВремяТема занятия
16:00 - 18:40Доклад Екатерины Носовой «Математические методы в эпидемиологии на примере анализа данных о ВИЧ-инфекции»
16:40 – 17:00Перерыв
17:00 – 18:00Практическое занятие.
Сошников С.С. «Приступая к работе с SAS».
21 Февраля 2013 
ВремяТема занятия
16:00 - 18:40Доклад Сергея Сошникова «Использование Data Mining для медико-социальных показателей Росстата»
16:40 – 17:00Перерыв
17:00 – 18:00Практическое занятие.
Сошников С.С. «Приступая к работе с SAS II».
 
Для практического занятия желательно иметь с собой ноутбук.

Подробности можно узнать по телефону: +7(916)0632545
Предварительная запись по E-mail: ssosh@mednet.ru
Новости кружка на Twitter: @EpidModel

воскресенье, 3 февраля 2013 г.

Импакт-фактор научных журналов по наркологии

    В приведенной ниже таблице приведено сравнение импакт-факторов журналов в области наркологии. Показатель цитируемости измерялся для трех различных временных промежутков. Левая колонка содержит импакт-фактор журналов на 2009 год, по действующей методологии Journal Citation Reports®.
 В 2009 году импакт-фактор рассчитывался на основе числа всех текущих ссылок на источники, опубликованные в журнале за предыдущие два года и деления на количество статей, опубликованных в журнале за тот же период. Ранги журналов в двух первых столбцах показывают воздействие на цитируемость больших промежутков времени, на основе данных из  Journal Performance Indicators.
   
РангИмпакт-фактор
2009
Импакт-фактор
2005-09
Импакт-фактор
1981-2009
1 Addiction
(3.84)
Addiction
(8.03)
British Journal of Addiction
(25.56)
2 Journal of Substance Abuse
Treatment
(2.90)
Journal of Studies on
Alcohol
(7.01)
Journal of Studies on
Alcohol

(24.70)
3 Psychology of Addictive
Behaviors
(2.68)
Alcoholism – Clinical and
Experimental Research
(6.69)
Journal of Substance Abuse
(21.21)
4 International Journal of
Drug Policy
(2.54)
Drug and Alcohol
Dependence
(6.67)
Addiction
(21.15)
5 Addictive Behaviors
(2.25)
Addiction Biology
(6.31)
Research Advances in Alcohol & Drug Problems
(20.90)
6 Journal of Studies on Alcohol
and Drugs
(2.07)
Psychology of Addictive
Behaviors
(5.38)
Alcoholism – Clinical and
Experimental Research
(20.57)
7 Drug and Alcohol Review
(1.65)
Alcohol
(5.35)
Drug and Alcohol Dependence
(17.21)
8 American Journal on Addictions
(1.53)
Journal of Substance Abuse
and Treatment
(5.10)
Addictive Behaviors
(15.44)
9 American Journal of Drug and Alcohol Abuse
(1.34)
Alcohol and Alcoholism
(4.54)
Alcohol
(15.21)
10 Journal of Gambling Studies
(1.28)
Addictive Behaviors
(4.22)
Psychology of Addictive
Behaviors
(15.10)


    Российские журналы "Вопросы наркологии", "Наркология" и другие имеют слишком низкое качество публикаций, а главное их статьи публикуются на русском языке и не представлены в открытом он-лайн доступе, поэтому не индексируются PubMed.
Российская наркология в шутку получила прозвище "суверенная наркология", поскольку почти не представлена в мировой медицинской науке.

SOURCE: http://archive.sciencewatch.com/dr/sci/11/apr10-11_2/